鱼类得病的原因较多，总结起来是因为：环境、鱼种和病原三者之间相互作用的结果。
如果环境发生了不利于鱼类生存的变化时，鱼体抵抗力会减弱，病原体感染侵袭，就容易引起鱼患病和死亡。
鱼是变温动物，体温会随着外界的环境条件而变化。在水温急剧升降时，鱼体会消耗部分能量来抵御环境的变化，导致鱼体及免疫力下降，很容易造成身体病理变化。
所以，水体的各种理化因素对鱼类的生活、生长、繁殖具有特殊作用。
如：鱼苗在下塘时一般要求池水温度相差不超过3℃，鱼种不超过4℃，否则温差过大可能引起鱼类大量死亡。
冬季池水恶化，鱼上浮贴冰冻伤，会造成冻伤部位寄发性细菌或真菌感染。
好的水体包括适宜的化学指标(PH、氨氮、亚硝酸盐、溶氧、硫化氢等)，适宜的水体生物量(浮游生物、有益菌等)，适宜的有机质含量。
而水体中的有毒物质铅、汞、锌、铬、铜、农药等容易引起鱼患病和死亡。
在拉网、转池、运输过程中操作不当易造成鱼体损伤，引起伤口寄发性细菌或真菌感染。
投喂量过大或投喂激素量太高的饲料，容易造成鱼前期生长过快、免疫系统发育不良或免疫机能差。
鱼种优良，体质健壮，抗病力强，患病率低。反之，鱼种差，营养不良，体质弱，对外界环境变化和病原侵袭等情况下鱼就容易患病。
不同种或同种的鱼体抗病力不同，这与其性别、鱼龄、食性、营养状况、机体结构、抗药性等都有关系。
在疾病流行季节，病毒、细菌、真菌、寄生虫及水体有害有毒浮游生物都可造成鱼类发病。所以，当病毒、细菌、真菌等感染鱼体后，即可引起各种传染性疾病，这类疾病的特点是发病快，来势猛，死亡率高。
当原生动物、吸虫、绦虫、棘头虫、小瓜虫、甲壳类等动物性病原体侵袭鱼体后，会引起各种侵袭性疾病，也就是我们常说的“寄生虫病”。
凶猛鱼类、吃鱼鸟类、水蛇、水生昆虫及幼虫，作为敌害生物的同时又是多种致病生物的携带者，如：龙虱和幼虫水蜈蚣均可伤害到幼鱼;青苔、湖淀等也会困死幼鱼。
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