淡水鱼主要发生的疾病是：白皮病、打印病、赤皮病、竖鳞病、烂鳃病、肠炎病、水霉病、小瓜虫病、鲤斜管虫病、车轮虫病、锚头鳋病、鲤嗜子宫线虫病、鲺病、肝胆综合症等。其中细菌性疾病6种、真菌性疾病1种、寄生虫性疾病6种、非寄生性疾病1种，没有病毒性疾病发生。
细心操作，避免鱼体受伤
细菌性疾病如白皮病、赤皮病、竖鳞病等和真菌性疾病如水霉病，均为继发性疾病，在捕捞、运输、放苗等操作过程中造成的机体损伤，使这些疾病得以发生，为此，进行细心操作，避免鱼体受伤是防止微生物类疾病发生的保证。
加强疾病检疫，投放前及时用药治愈
池塘投放的鱼种，如果不进行检疫，不对症用药进行及时处理，一旦投放到池塘中，随着水温的提高，养殖密度的增加，病原会大量繁殖、生长，感染率增加，带来鱼类生长缓慢甚至死亡，后果不堪设想。为此，在鱼种进入池塘前，要进行检疫，并对症用药，是防止疾病发生的必要环节。药物浸泡可用食盐、漂******与高锰酸钾等。
流行季节前的药物预防
对养殖场日常管理的了解，许多疾病的发生是有季节性的，如肠炎病、烂鳃病、锚头鳋病等，在疾病的流行季节前用药物进行预防，可以控制疾病的发生，如：挂袋法、食场消毒法、全池泼洒等。
加强养殖水体环境保护，适时调节水质
维护良好的水质不仅是养殖动物生存的需要，同时也是养殖动物抗病原生物侵扰的需要，随着水温的提高和养殖密度的加大，病原繁殖和生长加快，疾病得以大量发生，加强养殖水体环境保护，适时调节水质十分重要，水体的深度：鱼种培育的水体从初期的1m到后期的2m左右；成鱼饲养的水体从初期的1.3m到后期的2.4m左右，平时逐渐加水，当水体不好时，要采取排老水注新水的方法，这也是促进鱼类快速生长，避免水体有毒有害物质如氨、亚硝酸盐含量超标的保证。适时适量使用微生物制剂，能够改善和优化养殖水环境，并且能促进养殖动物正常生长和发育。在产业化养殖的中、后期要根据养殖池塘底质、水质情况每月使用2次～3次微生物制剂。
