菠萝和凤梨只是同一个物种的不同名称，类似于土豆和马铃薯，番茄和西红柿。
在学术上，凤梨是学名，而菠萝是俗称，详细信息可参见中国生物物种名录。在生活中，我们拿来比较的凤梨和菠萝只是两个不同的品种。
菠萝
凤梨
大多数人所说的菠萝一般指巴厘这个品种，在广西、广东、福建、海南、云南、台湾等地都有种植，比较常见。凤梨一般指金钻或台农17号，主要产地在台湾。
巴厘这一品种的叶子带有小锯齿，果眼深，成熟的巴厘仍然带有酸味，直接吃会有刺痛感，需要泡盐水去酸后食用。金钻或台农17号可以说是巴厘的改良版，叶子边缘不带锯齿，果眼比较浅，只需要简单削皮即可。甜度也比巴厘高，不泡盐水也能吃。
所以所谓的菠萝和凤梨的区别只是两个不同品种的区别。
