1、对大肠杆菌的用药一定要遵循尽量窄谱的原则，能用窄谱的抗生素就不选用广谱抗生素。
2、对大肠杆菌病尽量要根据药敏实验选用敏感药物进行治疗，并尽早使用，避免用药的盲目性，力求用药的准确有效。对于败血性大肠杆菌病要选用敏感药物且肠道吸收良好的药物，或者是两者合理搭配使用才能奏效，肠道吸收不好的药物如新霉素、庆大、丁胺卡那等因不能到达全身而不能杀灭大肠杆菌效果不良。
3、大肠杆菌的用药时间，第一次尽量选在早晨6-8点时使用，因此时鸡体营养状态不良、大肠杆菌容易侵害、而相应大肠杆菌的细胞壁较薄，药物能够充分发挥作用。
4、大肠杆菌的用药次数最少每天使用用2次，因为，大肠杆菌的繁殖速度特快，大约18-20分钟就能繁殖一次，如果，用药次数过少（如一次用药）用药时间过短，则药物浓度可能因随着体内的降解而下降，使药物浓度达不到治疗浓度而使大肠杆菌重新繁殖再生，并有可能产生抗药性。而两次以上给药能避免这一点。
5、大肠杆菌病的疗程一定要足，一般败血型大肠杆菌病的疗程在5-7天以上才行，如停药过早会前功尽弃，死灰复燃。
6、大肠杆菌用药的剂量要足，如用药量不足，就会给大肠杆菌提供苟延残喘的机会，使治疗难以奏效。
7、一定要对原发病进行及时准确的治疗，只有这样大肠杆菌的治疗才能够充分奏效。
8、益生素等微生物制剂对大肠杆菌病的治疗和恢复有很客观的效果，特别是对治疗过后添加对肠道细菌群失调的调理有着很重要的意义。
9、大肠杆菌用药后，最好继续添加高剂量的电解多维素等，促进大肠杆菌毒素的排除，以恢复机体抵抗力。
10、饲养管理不良如通风不良、氨气过多、湿度过大、温度过低、密度过大、营养不平衡，应激，中毒等都会促进大肠杆菌病的发生，所以，治疗时要加强这些方面才行。
